Le Conseil de l’Europe coopère avec intérêt avec le Monténégro, par le biais de six actions actuellement en cours dans le cadre de la Facilité horizontale Union européenne/Conseil de l'Europe pour les Balkans occidentaux et la Turquie dans les domaines de la justice, du pénitentiaire, du crime économique et de l’éducation. Le Conseil de l'Europe est actuellement représenté par un Bureau des programmes créé pour la mise en œuvre des projets en cours.

Le Monténégro est également bénéficiaire de quatre programmes régionaux en Europe du Sud-Est, dont trois programmes conjoints du Conseil de l’Europe et de l’Union Européenne, visant à apporter un soutien régional à la «Promotion de la bonne gouvernance et de l’autonomisation des Roms au niveau local (ROMACTED)», «Approfondir les connaissances sur la dimension judiciaire de la liberté d’expression et des médias en Europe du Sud-Est (JUFREX)» , et à renforcer la «Coopération internationale en matière de lutte contre la Cybercriminalité (iPROCEEDS)» . Le quatrième programme, financé par le Fonds fiduciaire pour les droits de l'homme, offre une éducation sur les droits de l’homme aux professionnels du droit «Éducation aux droits de l'homme pour les professionnels du droit, HELP».