La division de l'audit interne entretient des contacts réguliers avec des services similaires d'autres organisations internationales, en particulier avec l'OCDE, Interpol, le CERN, l'OTAN, l'UNESCO et les bureaux des Nations Unis à Genève. Ces contacts lui permettent de partager des bonnes pratiques, des outils et des méthodologies.

La fonction de l'évaluation a été évaluée en 2017 par l’Agence de Développement et de Coopération suisse. Cette dernière a émis plusieurs recommandations qui sont en cours de mise en œuvre. La division de l’évaluation coopère avec les bureaux de l'évaluation de la Commission européenne et maintient des contacts réguliers avec les délégations de l'Union européenne et autres donneurs représentant les pays dans lesquels les évaluations sont menées.

La division de l'évaluation est également un membre institutionnel de la Société européenne pour l'évaluation, ce qui lui permet de se tenir informée des développements dans son champ d'intervention.