Toute ONG désirant solliciter une subvention auprès du Fonds Européen pour la Jeunesse doit s'enregistrer en ligne. Une fois enregistrées, les ONG peuvent faire des demandes de subventions, en suivant le processus de Demande de subvention, et selon les dates limites en place. Les projets doivent être en adéquation avec les  priorités actuelles du secteur jeunesse du Conseil de l’Europe. Après, le Comité de Programmation pour la Jeunesse prend les décisions concernant les demandes; ce processus est expliqué dans la page "Qui décide et comment". La page "Subventions accordées" offre des informations sur les projets approuvés. Les pages "Vos obligations" et "Rapport" incluent des informations sur les obligations par rapport aux ONG dont les projets ont été approvés. La page "Reconnaissance du temps des bénévoles" explique la méthode utilisée par le FEJ pour reconnaitre le temps que les bénévoles consacrent aux activités de jeunesse soutenues par le FEJ. Finalement, la page "Responsabilité" explique comment le FEJ est transparent et responsable par rapport à l'utilisation de ses fonds. 

Le FEJ soutient uniquement les organisations non gouvernementales de jeunesse basées dans l’un des pays signataires de la Convention culturelle européenne (46 Etats membres du Conseil de l’Europe ainsi que le Kazakhstan, le Saint-Siège et le Bélarus).

Les ONG désirant déposer une demande pour une subvention doivent d’abord s’enregistrer en ligne.