Frédérique Neau-Dufour est agrégée et docteur en histoire. Après avoir enseigné l'histoire et la géographie jusqu'en 1998, Frédérique Neau-Dufour est nommée chargée de recherche à la Fondation Charles-de-Gaulle. Elle a été commissaire de l'exposition au mémorial Charles-de-Gaulle de Colombey-les-Deux-Églises, de l'exposition itinérante "Charles de Gaulle et Konrad Adenauer, une amitié franco-allemande", et de La Boisserie, maison familiale du général de Gaulle, jusqu'en 2009. Elle est ensuite nommée conseillère à la mémoire au cabinet d'Hubert Falco, secrétaire d'État à la Défense et aux Anciens combattants, pour préparer le 70e anniversaire de l'Appel du 18 juin. De 2011 à 2019, elle dirige le Centre européen du résistant déporté (CERD) situé sur le site de l'ancien camp de concentration du Struthof (Bas-Rhin).